防獭兔球虫病首选要为兔子营造良好的卫生环境。夏季苍蝇很多，消灭苍蝇，及时处理病死兔子，保持通风量大、干燥度高的饲养环境。

其次加强饲料管理，饲料要经高温制粒。饮水清洁，青饲草用0.03%高锰酸钾水洗涤晾干后再喂。尽量避免兔粪污染食具和饮水。另外禁止未作处理的兔粪直接用于饲草种植，避免二次感染。每10天对兔笼食槽及笼底板彻底消毒一次。

最后新留种的后备种兔或新购入的种兔都要隔离检疫，并经过多次粪便检查，确定无虫，健康的兔只再作种留用，对高度感染的一律淘汰。